ପଲିପେପ୍ଟାଇଡ୍ ପେପ୍ଟାଇଡ୍ ଶୃଙ୍ଖଳର ଡିଜାଇନ୍ ସ୍କିମ୍ ଏବଂ ସମାଧାନ |

I. ସାରାଂଶ
ପେପ୍ଟାଇଡସ୍ ହେଉଛି ସ୍ୱତନ୍ତ୍ର ମାକ୍ରୋମୋଲ୍ୟୁକ୍ୟୁଲ୍ ଯେପରିକି ସେମାନଙ୍କର ରାସାୟନିକ ଏବଂ ଶାରୀରିକ ବ in ଶିଷ୍ଟ୍ୟରେ ସେମାନଙ୍କର କ୍ରମ ଅସାଧାରଣ ଅଟେ |କେତେକ ପେପ୍ଟାଇଡ୍ ସିନ୍ଥାଇଜ୍ କରିବା କଷ୍ଟକର ହୋଇଥିବାବେଳେ ଅନ୍ୟଗୁଡିକ ସିନ୍ଥାଇଜ୍ କରିବା ଅପେକ୍ଷାକୃତ ସହଜ କିନ୍ତୁ ଶୁଦ୍ଧ କରିବା କଷ୍ଟକର |ବ୍ୟବହାରିକ ସମସ୍ୟା ହେଉଛି ଅଧିକାଂଶ ପେପ୍ଟାଇଡ୍ ଜଳୀୟ ସମାଧାନରେ ସାମାନ୍ୟ ଦ୍ରବୀଭୂତ ହୁଏ, ତେଣୁ ଆମର ଶୁଦ୍ଧକରଣରେ, ହାଇଡ୍ରୋଫୋବିକ୍ ପେପ୍ଟାଇଡ୍ର ଅନୁରୂପ ଅଂଶ ଅଣ-ଜଳୀୟ ଦ୍ରବଣରେ ଦ୍ରବୀଭୂତ ହେବା ଆବଶ୍ୟକ, ତେଣୁ, ଏହି ଦ୍ରବଣ କିମ୍ବା ବଫର୍ ବ୍ୟବହାର ସହିତ ଗୁରୁତର ଅସଙ୍ଗତ ହେବାର ସମ୍ଭାବନା ଅଛି | ଜ bi ବିକ ପରୀକ୍ଷାମୂଳକ ପ୍ରଣାଳୀ, ଯାହା ଦ୍ techn ାରା ଟେକ୍ନିସିଆନମାନେ ନିଜ ଉଦ୍ଦେଶ୍ୟରେ ପେପ୍ଟାଇଡ୍ ବ୍ୟବହାର କରିବାକୁ କଡା ନିଷେଧ ଅଟନ୍ତି, ଯାହାଫଳରେ ଅନୁସନ୍ଧାନକାରୀଙ୍କ ପାଇଁ ପେପ୍ଟାଇଡ୍ ଡିଜାଇନ୍ ର ନିମ୍ନଲିଖିତ ଦିଗଗୁଡ଼ିକ ନିମ୍ନଲିଖିତ ଅଟେ |

ପଲିପେପ୍ଟାଇଡ୍ ପେପ୍ଟାଇଡ୍ ଶୃଙ୍ଖଳର ଡିଜାଇନ୍ ସ୍କିମ୍ ଏବଂ ସମାଧାନ |
ଦ୍ୱିତୀୟତ synt, ସିନ୍ଥେଟିକ୍ କଠିନ ପେପ୍ଟାଇଡ୍ସର ସଠିକ୍ ପସନ୍ଦ |
1. ନିମ୍ନ-ନିୟନ୍ତ୍ରିତ କ୍ରମର ମୋଟ ଦ length ର୍ଘ୍ୟ |
15 ରୁ କମ୍ ଅବଶିଷ୍ଟ ପେପ୍ଟାଇଡ୍ ପାଇବା ସହଜ କାରଣ ପେପ୍ଟାଇଡ୍ ର ଆକାର ବ increases ିଥାଏ ଏବଂ ଅଶୋଧିତ ଦ୍ରବ୍ୟର ଶୁଦ୍ଧତା କମିଯାଏ |ଯେହେତୁ ପେପ୍ଟାଇଡ୍ ଶୃଙ୍ଖଳାର ମୋଟ ଦ length ର୍ଘ୍ୟ 20 ଅବଶିଷ୍ଟାଂଶରୁ ଅଧିକ ବ increases େ, ସଠିକ୍ ଉତ୍ପାଦ ପରିମାଣ ଏକ ମୁଖ୍ୟ ଚିନ୍ତାର ବିଷୟ |ଅନେକ ପରୀକ୍ଷଣରେ, ଅବଶିଷ୍ଟ ସଂଖ୍ୟାକୁ 20 ରୁ କମ୍ କରି ଅପ୍ରତ୍ୟାଶିତ ପ୍ରଭାବ ପାଇବା ସହଜ |
2. ହାଇଡ୍ରୋଫୋବିକ୍ ଅବଶିଷ୍ଟ ସଂଖ୍ୟା ହ୍ରାସ କରନ୍ତୁ |
ହାଇଡ୍ରୋଫୋବିକ୍ ଅବଶିଷ୍ଟାଂଶଗୁଡିକର ଏକ ବୃହତ ପ୍ରାଧାନ୍ୟ ଥିବା ପେପ୍ଟାଇଡ୍, ବିଶେଷତ the ସି-ଟର୍ମିନାସ୍ର 7-12 ଅବଶିଷ୍ଟ ଅଞ୍ଚଳରେ ସିନ୍ଥେଟିକ୍ ଅସୁବିଧା ସୃଷ୍ଟି କରିଥାଏ |ଏହା ଏକ ଅନୁପଯୁକ୍ତ ମିଶ୍ରଣ ଭାବରେ ସଠିକ୍ ଭାବରେ ଦେଖାଯାଏ କାରଣ ସିନ୍ଥେସିସରେ ଏକ ବି-ଫୋଲ୍ ସିଟ୍ ମିଳିଥାଏ |"ଏପରି ପରିସ୍ଥିତିରେ, ଦୁଇଟିରୁ ଅଧିକ ସକରାତ୍ମକ ଏବଂ ନକାରାତ୍ମକ ଅବଶିଷ୍ଟାଂଶକୁ ରୂପାନ୍ତର କରିବା କିମ୍ବା ପେପ୍ଟାଇଡ୍ ରଚନାକୁ ଖୋଲିବା ପାଇଁ ଗ୍ଲାଇ କିମ୍ବା ପ୍ରୋକୁ ପେପ୍ଟାଇଡରେ ରଖିବା ଉପଯୋଗୀ ହୋଇପାରେ।"
3. “କଷ୍ଟସାଧ୍ୟ” ଅବଶିଷ୍ଟଗୁଡ଼ିକର ନିୟନ୍ତ୍ରଣ |
ସେଠାରେ ଅନେକଗୁଡ଼ିଏ ସାଇସ୍, ମେଟ୍, ଆର୍ଗ, ଏବଂ ଚେଷ୍ଟା କରନ୍ତୁ ଯାହାକି ସାଧାରଣତ easily ସହଜରେ ସିନ୍ଥାଇଜ୍ ହୋଇନଥାଏ | ”ସର୍ ସାଧାରଣତ C Cys ପାଇଁ ଏକ ଅଣ-ଅକ୍ସିଡେଟିଭ୍ ବିକଳ୍ପ ଭାବରେ ବ୍ୟବହୃତ ହେବ |
ପଲିପେପ୍ଟାଇଡ୍ ପେପ୍ଟାଇଡ୍ ଶୃଙ୍ଖଳର ଡିଜାଇନ୍ ସ୍କିମ୍ ଏବଂ ସମାଧାନ |

ତୃତୀୟତ water, ପାଣିରେ ଦ୍ରବୀଭୂତ ସଠିକ୍ ପସନ୍ଦକୁ ଉନ୍ନତ କରନ୍ତୁ |
1. N କିମ୍ବା C ଟର୍ମିନାସ୍ ଆଡଜଷ୍ଟ୍ କରନ୍ତୁ |
ନକାରାତ୍ମକ ଚାର୍ଜ ବ to ାଇବା ପାଇଁ ଅମ୍ଳୀୟ ପେପ୍ଟାଇଡସ୍ (ଅର୍ଥାତ୍ pH 7 ରେ ନକାରାତ୍ମକ ଭାବରେ ଚାର୍ଜ କରାଯାଏ), ଆସେଟିଲେସନ୍ (N- ଟର୍ମିନାସ୍ ଆସେଟିଲେସନ୍, ସି ଟର୍ମିନାସ୍ ସର୍ବଦା ଏକ ମାଗଣା କାର୍ବକ୍ସିଲ୍ ଗୋଷ୍ଠୀ ବଜାୟ ରଖିବା) ସହିତ ବିଶେଷ ଭାବରେ ପରାମର୍ଶ ଦିଆଯାଏ |ଅବଶ୍ୟ, ମ basic ଳିକ ପେପ୍ଟାଇଡସ୍ ପାଇଁ (ଅର୍ଥାତ୍ pH 7 ରେ ସକରାତ୍ମକ ଭାବରେ ଚାର୍ଜ କରାଯାଏ), ସକରାତ୍ମକ ଚାର୍ଜ ବ to ାଇବାକୁ ଆମିନେସନ୍ (N- ଟର୍ମିନାସରେ ମାଗଣା ଆମିନୋ ଗ୍ରୁପ୍ ଏବଂ ସି-ଟର୍ମିନାସରେ ଆମିନେସନ୍) ବିଶେଷ ଭାବରେ ପରାମର୍ଶ ଦିଆଯାଏ |

2. କ୍ରମକୁ ବହୁତ ଛୋଟ କିମ୍ବା ଲମ୍ୱା କରନ୍ତୁ |

କେତେକ କ୍ରମରେ ବହୁ ସଂଖ୍ୟକ ହାଇଡ୍ରୋଫୋବିକ୍ ଆମିନୋ ଏସିଡ୍ ଥାଏ, ଯେପରିକି Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr ଏବଂ Ala ଇତ୍ୟାଦି ଯେତେବେଳେ ଏହି ହାଇଡ୍ରୋଫୋବିକ୍ ଅବଶିଷ୍ଟାଂଶ 50% ରୁ ଅଧିକ ହୁଏ, ସେଗୁଡିକ ସାଧାରଣତ ol ତରଳିବା ସହଜ ନୁହେଁ |ପେପ୍ଟାଇଡ୍ର ସକରାତ୍ମକ ଏବଂ ନକାରାତ୍ମକ ପୋଲକୁ ଆହୁରି ବ increase ାଇବା ପାଇଁ କ୍ରମକୁ ଲମ୍ୱା କରିବା ଉପଯୋଗୀ ହୋଇପାରେ |ଦ୍ୱିତୀୟ ବିକଳ୍ପ ହେଉଛି ହାଇଡ୍ରୋଫୋବିକ୍ ଅବଶିଷ୍ଟାଂଶକୁ ନିୟନ୍ତ୍ରଣ କରି ସକରାତ୍ମକ ଏବଂ ନକାରାତ୍ମକ ପୋଲ ବୃଦ୍ଧି କରିବାକୁ ପେପ୍ଟାଇଡ୍ ଶୃଙ୍ଖଳର ଆକାରକୁ ନିୟନ୍ତ୍ରଣ କରିବା |ପେପ୍ଟାଇଡ୍ ଶୃଙ୍ଖଳାର ସକରାତ୍ମକ ଏବଂ ନକାରାତ୍ମକ ଦିଗଗୁଡିକ ଯେତେ ଶକ୍ତିଶାଳୀ, ଜଳ ସହିତ ପ୍ରତିକ୍ରିୟା କରିବାର ସମ୍ଭାବନା ଅଧିକ |
3. ପାଣିରେ ଦ୍ରବୀଭୂତ ଅବଶିଷ୍ଟାଂଶ ରଖନ୍ତୁ |
କିଛି ପେପ୍ଟାଇଡ୍ ଶୃଙ୍ଖଳା ପାଇଁ, କିଛି ସକରାତ୍ମକ ଏବଂ ନକାରାତ୍ମକ ଆମିନୋ ଏସିଡ୍ ର ମିଶ୍ରଣ ଜଳର ଦ୍ରବଣରେ ଉନ୍ନତି ଆଣିପାରେ |ଆମ କମ୍ପାନୀ ଗ୍ଲୁ-ଗ୍ଲୁ ସହିତ ମିଶ୍ରିତ ହେବାକୁ ଥିବା ଏସିଡ୍ ପେପ୍ଟାଇଡସ୍ ର N-terminus କିମ୍ବା C-terminus କୁ ସୁପାରିଶ କରେ |ମ basic ଳିକ ପେପ୍ଟାଇଡ୍ର N କିମ୍ବା C ଟର୍ମିନାସ୍ ଦିଆଗଲା ଏବଂ ତା’ପରେ Lys-Lys |ଯଦି ଚାର୍ଜ ହୋଇଥିବା ଗୋଷ୍ଠୀକୁ ସ୍ଥାନିତ କରାଯାଇପାରିବ ନାହିଁ, ସେର-ଗ୍ଲୀ-ସେରକୁ ମଧ୍ୟ N କିମ୍ବା C ଟର୍ମିନାସରେ ରଖାଯାଇପାରିବ |ତଥାପି, ଯେତେବେଳେ ପେପ୍ଟାଇଡ୍ ଶୃଙ୍ଖଳାର ପାର୍ଶ୍ୱ ପରିବର୍ତ୍ତନ ହୋଇପାରିବ ନାହିଁ ସେତେବେଳେ ଏହି ପଦ୍ଧତି କାମ କରେ ନାହିଁ |